مشکلات CMOS در شرایط به خصوصممکن است لازم باشد که CMOS را پاک کنید بعضی مواقع که شمابرای بوت شدن سیستم کلمه عبور ( password) تعیین کرده ایدو آنها را فراموش کرده اید یا بعضی مواقع BIOS را به گونهای تنظیم کرده ایدکه مشکلاتی برای سیستم بوجود آورده ونمی توانید آن را درست کنید این راه مفید است. در بعضی مادربردها پاک کردن حافظه CMOS مادربرد باعث دردسر است زیرا تنظیم دوباره آن مشکلاست و شاید به یاد آوردن کلمه عبور راحتتر باشد ولی در مادربردهای امروزی معمولاًاین مشکل کمتر است چند راه برای پاک کردن حافظه CMOS وجوددارد بعضی از مادربردها جامپرهایی برای پاک کردن CMOS دارند که احتمالاً در دستور العمل استفاده از مادر برد به آن اشاره شدهاست جامپر را یک لحظه برداشته و دوباره سر جایش بگذارید و CMOS پاک می شود. در زمان انجام این کارمطمئن شویدکه سیستم شما ازتغذیه برق جدا شده است و بنابراین هیچ ولتاژی روی مادربرد نیست. راه طولانی تر ایناست که باطری سیستم را از محل خود خارج کنید این عمل باید دو روزی طول بکشد راه غیرایمن و سریعتر این است که بعد از برداشتن باتری مثبت و منفی جایگاه باتری را بوسیلهیک سیم به یکدیگر متصل کنید. سپس دوباره آن را در جای خود قرار دهیید اگر باطریمادربرد شما قابل برداشتن نیست باید با نمایندگیهای مادربردتان تماسبگیرید. زمان و تاریخ درسیستم به درستی نمایش داده نمی شود تنظیمات به هم ریخته یا خطای Dead Battery دریافت می کنید رفع این اشکال ساده است عمر باطری تمامشده است و باید آن را عوض کنید.